單一蛋白質(zhì)或者蛋白混合物的蛋白質(zhì)譜鑒定/分析，以及對單一蛋白質(zhì)的蛋白序列分析是生物學研究中經(jīng)常遇到的問題。基于質(zhì)譜法獲取蛋白質(zhì)序列的序列信息以及通過質(zhì)譜法進行蛋白質(zhì)質(zhì)譜鑒定，蛋白質(zhì)譜分析從而實現(xiàn)蛋白質(zhì)鑒定，既protein identification，基于LC-MS的蛋白質(zhì)譜鑒定。常見分析包括：質(zhì)譜測定蛋白分子量，蛋白的N端和C端測序，蛋白質(zhì)序列分析及，翻譯后修飾位點分析等。

百泰派克公司采用超高分辨率質(zhì)譜技術，基于Thermo Fisher公司的Q Exactive質(zhì)譜儀、LTQ Orbitrap Elite質(zhì)譜儀、Orbitrap Fusion™ Lumos™ Tribrid™ 質(zhì)譜儀，結(jié)合 Nano-LC液相色譜技術，能夠?qū)Φ鞍踪|(zhì)提取物、SDS-PAGE蛋白條帶、2D蛋白膠點、pull-down及co-IP等樣品中的蛋白質(zhì)進行高效精準的蛋白質(zhì)譜鑒定服務。

百泰派克可提供以下蛋白質(zhì)質(zhì)譜鑒定服務：

1，對純化蛋白進行蛋白質(zhì)質(zhì)譜分析/質(zhì)譜鑒定；
2，對蛋白膠點，蛋白質(zhì)膠條質(zhì)譜鑒定，蛋白銀染膠質(zhì)譜鑒定，考染/熒光/Zn/Cu2+等類型染色的膠點/膠條樣品進行鑒定；可參見：蛋白膠點、膠條、IP樣品蛋白質(zhì)鑒定服務
3，對pull-down蛋白質(zhì)譜鑒定、IP蛋白互作的IP-MS互作蛋白鑒定、co-IP質(zhì)譜驗證互作蛋白，免疫共沉淀結(jié)合質(zhì)譜驗證，等簡單混合物樣品中的蛋白樣品進行蛋白質(zhì)鑒定/分析。
4，對復雜樣品中的未知蛋白質(zhì)進行蛋白質(zhì)譜分析/蛋白質(zhì)譜鑒定。即使是非常低濃度的蛋白樣品也可能通過蛋白質(zhì)譜鑒定

對于單一蛋白質(zhì)和簡單蛋白混合物的鑒定，我們保證100%的鑒定率，否則不收任何費用。

NanoLC-MS/MS分析簡單或復雜混合物中的蛋白質(zhì)質(zhì)譜分析。樣品可以是來自于SDS-PAGE凝膠中的條帶或蛋白點，也可以是溶液樣品。（我司也提供1D 或2D SDS-PAGE服務，點擊了解詳情。）
 

百泰派克基于質(zhì)譜的蛋白質(zhì)質(zhì)譜鑒定流程:

樣品前處理
*先，用二硫蘇糖醇（DTT）還原蛋白質(zhì)樣品，用碘乙酰胺（IAA）烷基化。然后用胰蛋白酶對樣品進行消化，一般樣品會在賴氨酸和精氨酸殘基后發(fā)生斷裂。*后，凍干得到多肽片段。

上機分析
將樣品用NanoLC的A相重新溶解后上樣，在NanoLC-MS/MS系統(tǒng)下分析。

數(shù)據(jù)庫檢索
根據(jù)樣品物種來源從UniProt下載對應物種的蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)庫，使用MaxQuant、Proteome Discoverer、Peaks等軟件將液質(zhì)聯(lián)用得到的數(shù)據(jù)與數(shù)據(jù)庫中數(shù)據(jù)進行匹配，通過肽段的一級和二級碎片的質(zhì)量在數(shù)據(jù)庫中找到匹配的蛋白質(zhì)，從而鑒定樣品中的蛋白質(zhì)。

如果樣品的物種還沒有完整的蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)庫，我們將使用親緣較近物種的蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)庫或者是同種模式生物的蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)庫進行蛋白鑒定分析。

出具報告
鑒定報告中會包括詳細的樣品前處理步驟，色譜-質(zhì)譜平臺參數(shù)，以及鑒定得到的蛋白質(zhì)列表和肽段列表。質(zhì)譜原始數(shù)據(jù)會通過網(wǎng)盤形式提供。

您只需把您的樣品收集后提供給我們，后續(xù)所有步驟均由我們完成。百泰派克公司基于質(zhì)譜的蛋白質(zhì)質(zhì)譜鑒定/質(zhì)譜分析服務包括：樣品前處理-蛋白還原烷基化后使用高度特異性的蛋白酶進行蛋白樣品消化，獲得多肽片段；上機分析-通過納升級色譜（nano-flow）結(jié)合高分辨率質(zhì)譜，在*高的靈敏度下對肽段進行分離并使用超高分辨率質(zhì)譜儀采集肽段質(zhì)譜數(shù)據(jù)；數(shù)據(jù)庫檢索-結(jié)合樣品物種對應的蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫對成千上萬張質(zhì)譜圖進行分析（使用Uniprot數(shù)據(jù)庫，每月更新一次數(shù)據(jù)庫，以確保訪問*新數(shù)據(jù)），從而實現(xiàn)樣品中蛋白的蛋白質(zhì)質(zhì)譜鑒定；到*后出具樣品報告，均由百泰派克公司一站式完成：

1. 客戶提供了包含一種或多種蛋白質(zhì)的樣品，如膠條，膠帶，溶液或固體樣品，pull-down或co-IP樣品。
2. 百泰派克公司根據(jù)樣品情況，選擇合適的酶，對來樣進行蛋白酶消化，然后進行nanoLC-MS / MS分析。
3. 對獲取的數(shù)據(jù)進行搜庫分析。
4. 在10-15個工作日內(nèi)收到報告。

*如果您的樣品中含有洗滌劑/裂解劑，請在送樣單中注明。