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蛋白相互作用是指兩個及以上的蛋白質(zhì)分子結(jié)合形成蛋白質(zhì)復(fù)合體的一個過程。一般情況下蛋白質(zhì)很難單獨發(fā)揮作用,都是由多個蛋白質(zhì)分子的相互協(xié)調(diào)共同實現(xiàn)復(fù)雜的細胞功能。因此專注于蛋白相互作用的研究更加利于探索疾病的發(fā)生發(fā)展、找尋特定的疾病預(yù)測治療方法,并且在新藥研發(fā)的研究方面提供新的思路。蛋白質(zhì)互作分析的方法較多,百泰派克提供蛋白質(zhì)互作分析服務(wù),及后續(xù)基于液質(zhì)聯(lián)用技術(shù)(LC-MS/MS)對IP、Co-IP樣品及GST融合蛋白Pull-down等純化樣本中的蛋白/蛋白混合物的質(zhì)譜鑒定分析服務(wù)。詳情參見:
蛋白質(zhì)相互作用質(zhì)譜分析
免疫共沉淀法(CO-IP)結(jié)合質(zhì)譜聯(lián)用的蛋白互作分析
GST融合蛋白Pull-down技術(shù)結(jié)合質(zhì)譜聯(lián)用的蛋白互作分析
SILAC與免疫共沉淀結(jié)合質(zhì)譜聯(lián)用的蛋白互作分析
免疫共沉淀法(CO-IP)利用抗原抗體之間的特異性來檢測蛋白質(zhì)之間的生理性相互作用的一種方式。*先在實驗中為了*大限度的保留細胞中蛋白的相互作用,會使用非離子變性劑來裂解細胞。當(dāng)細胞裂解時,細胞內(nèi)的蛋白相互作用被保存下來,在其中加入相應(yīng)的抗體,使抗體與細胞中的特異蛋白質(zhì)結(jié)合,再加入蛋白A/G形成抗體蛋白復(fù)合物,進行離心、分離,使抗體蛋白復(fù)合物沉淀,棄去上清液,*后用質(zhì)譜技術(shù)鑒定沉淀下來的蛋白質(zhì),進而證明兩者間的相互作用。僅適用于分析穩(wěn)定或者強烈的蛋白質(zhì)間相互作用;通常用來鑒定某個目標(biāo)蛋白質(zhì)與另一個蛋白質(zhì)之間相互作用或者被用來尋找與某個目標(biāo)蛋白質(zhì)存在相互作用的未知蛋白質(zhì)。
百泰派克生物科技針對樣品蛋白的提取,表達和純化的優(yōu)化方案可確保獲得高質(zhì)量的誘餌和獵物蛋白,為客戶提供優(yōu)質(zhì)的Co-IP蛋白互作分析服務(wù)及對免疫共沉淀CO-IP獲取的蛋白進行蛋白質(zhì)譜分析。
• 優(yōu)點:可分離得到天然狀態(tài)下相互作用的蛋白復(fù)合物;
• 缺點:靈敏度較低;不能進行親和力低和瞬間的蛋白質(zhì)相互作用分析檢測。
GST融合蛋白pull-down沉降技術(shù),利用基因重組將帶有GST標(biāo)簽的載體插入到目標(biāo)蛋白A上,谷胱甘肽包裹的磁珠與目標(biāo)融合蛋白結(jié)合,加入細胞裂解液后,具有相互作用的蛋白被融合蛋白吸附,加入過量的谷胱甘肽進行洗脫,*后用MS技術(shù)分析。這種方法主要是研究體外強烈或者穩(wěn)定的蛋白質(zhì)間相互作用;可以鑒定兩種已知的感興趣蛋白質(zhì)可能存在的直接相互作用;尋找可能與目標(biāo)蛋白存在相互作用關(guān)系的未知蛋白。
作為技術(shù)依托型的科研技術(shù)服務(wù)公司,百泰派克生物科技在蛋白互作分析服務(wù)及基于質(zhì)譜的互作蛋白質(zhì)質(zhì)譜鑒定分析方面擁有多年經(jīng)驗。百泰派克提供基于GST pull-down蛋白互作分析服務(wù),及Pull-down靶蛋白質(zhì)譜鑒定服務(wù)。我們以嚴(yán)格的質(zhì)量控制和較短的檢測周期為特色,百泰派克向客戶提供可定制的一站式服務(wù),涵蓋您項目中從基因合成到數(shù)據(jù)報告的每個步驟。
• 優(yōu)點:可排除細胞內(nèi)其他情況的干擾;可以直接檢測蛋白質(zhì)之間是否有相互作用;方法簡單,操作方便。
• 缺點:在細胞外進行,不能準(zhǔn)確的反應(yīng)細胞內(nèi)的蛋白質(zhì)相互作用關(guān)系。
利用SILAC方法分別標(biāo)記實驗組和對照組細胞后進行Co-IP實驗,依靠抗原與抗體之間的專一性反應(yīng)分離得到免疫復(fù)合物;再通過LC-MS/MS來定性/定量檢測免疫復(fù)合物中的蛋白;當(dāng)實驗組與對照組中某個蛋白質(zhì)的含量達到統(tǒng)計學(xué)差異時,判定這個蛋白質(zhì)與研究的蛋白具有相互作用,可極大降低蛋白質(zhì)互作假陽性結(jié)果可能性。SILAC技術(shù)和Co-IP-MS技術(shù)結(jié)合可用于高通量定量分析在特定情況下蛋白的互作蛋白網(wǎng)。
百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Q ExactiveHF質(zhì)譜平臺,Orbitrap Fusion質(zhì)譜平臺,Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜平臺結(jié)合Nano-LC,提供SILAC與免疫共沉淀質(zhì)譜聯(lián)用的蛋白互作分析服務(wù)技術(shù)包裹(SILAC-based CoIP-MS),您只需要將您的實驗?zāi)康母嬖V我們并將您的細胞寄給我們,我們會負(fù)責(zé)項目后續(xù)所有事宜,包括細胞培養(yǎng)、細胞標(biāo)記、蛋白提取、抗體IP、效率檢測、蛋白酶切、肽段分離、質(zhì)譜分析、質(zhì)譜原始數(shù)據(jù)分析、生物信息學(xué)分析。
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