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蛋白質(zhì)非標記定量技術(shù)(Label Free)是通過液質(zhì)聯(lián)用技術(shù)對蛋白質(zhì)酶解肽段進行質(zhì)譜分析,無需使用昂貴的穩(wěn)定同位素標簽做內(nèi)部標準,只需分析大規(guī)模鑒定蛋白質(zhì)時所產(chǎn)生的質(zhì)譜數(shù)據(jù),比較不同樣品中相應(yīng)肽段的信號強度,從而對肽段對應(yīng)的蛋白質(zhì)進行相對定量。
基于SILAC和iTRAQ的定量蛋白組學研究技術(shù)都是*先標記蛋白然后利用質(zhì)譜進行分析;盡管提供的蛋白定量信息量巨大,但是標記試劑比較昂貴,每一個樣品的成本較大,因此比較適合在整個蛋白組水平上對蛋白的表達變化進行定量的分析;對于相對簡單的蛋白混合物,比如說co-IP的樣品來說,投入產(chǎn)出比比較低;對于某些翻譯后修飾方式的蛋白組學研究來說,比如泛素化研究,本身泛素化就是發(fā)生在賴氨酸上側(cè)鏈上,對于泛素化肽段的富集是利用針對賴氨酸側(cè)鏈上殘留的兩個甘氨酸(gly-gly)的抗體來實現(xiàn)的,但是iTRAQ試劑的標記會對此富集過程產(chǎn)生很大的影響,因此就不能使用iTRAQ標記技術(shù)對組織樣品的泛素化修飾進行組學水平上的分析。Label Free定量分析技術(shù)就是基于此實驗需求建立起來的定量蛋白組學技術(shù)。 同一個肽段在質(zhì)譜分析過程中離子化效率相同,質(zhì)譜峰的面積就直接代表了該肽段量的多少,因此可以直接通過比較同一肽段質(zhì)譜峰面積的方法直接得到該肽段所代表的蛋白的相對定量信息。
百泰派克公司采用Thermo Fisher的Q ExactiveHF質(zhì)譜平臺,Orbitrap Fusion質(zhì)譜平臺,Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜平臺結(jié)合Nano-LC,推出基于Label Free的定量蛋白組分析服務(wù)技術(shù)包裹,您只需要將您的實驗?zāi)康母嬖V我們并將您的細胞寄給我們,我們會負責項目后續(xù)所有事宜,包括細胞培養(yǎng)、細胞標記、蛋白提取、蛋白酶切、肽段分離、質(zhì)譜分析、質(zhì)譜原始數(shù)據(jù)分析、生物信息學分析。
1. 如果您提供的是co-IP樣品,蛋白需求量在2-5ug左右,在寄送蛋白樣品中不要包含去污劑(例如SDS)以及高的氧濃度;或者您可以直接將含有蛋白樣品的beads寄給我們,由我們負責后續(xù)的實驗。
2. 如果您提供的是組織樣品,請您干冰將組織樣品寄給我們;動物樣本大于200mg,血液樣品至少1ml(血漿注意用EDTA防凝),血清0.2-0.5ml,尿液2ml,植物樣品至少1g,細胞樣品為1X107個細胞,酵母、微生物等干重200mg。
3. 如果您提供的是蛋白樣品,請您保證蛋白總量在50ug以上;蛋白提取時使用普通的組織、細胞裂解液即可。
4. 樣品運輸:請使用足量的干冰運輸,并且盡量選用較快的郵遞方式,以降低運輸過程中樣品降解的可能性。
在技術(shù)報告中,百泰派克會為您提供詳細的中英文雙語版技術(shù)報告,報告包括:
1. 實驗步驟(中英文)
2. 相關(guān)的質(zhì)譜參數(shù)(中英文)
3. 鑒定的磷酸化位點的詳細信息
4. 質(zhì)譜圖片
5. 原始數(shù)據(jù)
您只需下單-寄送樣品
百泰派克一站式服務(wù)完成:樣品處理-上機分析-數(shù)據(jù)分析-項目報告
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